与朱元璋的多疑暴虐不同，壮年早逝的皇太子朱标的性格比较宽容敦厚，后来他的儿子建文帝朱允炆也继承了他这种性格。朱元璋觉得太子过于宽厚，希望他更严厉一些，而皇太子也经常觉得父亲过于暴虐苛刻。曾经有一个传说，说是太子向皇帝进言，请他不要杀人过多，朱元璋就把一根满是荆刺的条杖扔在地上让太子去拿。看到太子无处下手的窘状，朱元璋这才说：“我现在所做的一切，正是为你去掉这些扎手的荆刺，否则将来你怎么坐江山？”太子却不以为然，说有什么样的皇帝就有什么样的臣民，这一下把朱元璋气得大发雷霆，顺手抄起一把椅子就朝太子扔过去，吓得太子只好逃跑。从这个故事里，可以看出朱元璋和朱标完全是不同的性格和治国思路。 　　皇帝和太子意见不合，夹在中间的大臣也跟着倒霉。有一次朱元璋要大开杀戒，皇太子复审案卷时却打算从宽处理，朱元璋就问御史袁凯究竟自己和太子谁对谁错，袁凯不好直说，只好回答说皇帝是为了执法，太子是出于仁慈。朱元璋听了大发脾气，说袁凯是在耍滑头，想要两边讨好，这一下把袁凯吓坏了，干脆也装疯扮傻起来，任凭朱元璋怎么命人折磨他也不声不响，回家后自己用铁链锁住脖子，蓬头乱发唱歌不止，做出种种疯癫的举动，骗过了朱元璋派来探察的使者，总算留住一条命。 　　后来太子朱标早逝，朱元璋伤心不已，让谁当继承人就成了心头一件大事。皇太孙朱允炆年纪太小，朱元璋怕他做不稳皇位，就有些想把大位传给和自己颇为相似的四子燕王朱棣。据说有一次朱元璋出了一个上联“风吹马尾千条线”让朱棣和朱允炆来对，结果朱允炆说了句“雨打羊毛一片膻”，让朱元璋很生气，而朱棣开口却是“日照龙鳞万点金”，颇有帝王气象，朱元璋不禁喜出望外。但改变继承人毕竟是件大事，他自己也犹豫不决，就去和大臣商量。大臣回答说：如果让第四个儿子当太子，那么老二老三往哪儿摆？他们的心里会服燕王吗？一句话说进了朱元璋心里，他也只能感叹说：“一切都看天意吧！” 　　朱元璋平时很注意对儿子们的教育，把许多儿子都培养得精明能干。后来几次大案把开国元勋宿将几乎杀光，他就把对蒙古势力的防务交给了燕王等几个儿子，北边一线成了他们的封地。正是在边境的守御生涯锻炼了朱棣的能力，也培养了他的势力，后来他能够夺取朱允炆的皇位，这也是重要的原因之一。 　　洪武三十一年（公元1398年）五月，七十一岁的朱元璋患病卧床不起，三十天以后去世。他被葬在南京城外钟山下的明孝陵中，周围是几座功臣陪葬墓，墓主分别是开平王常遇春、中山王徐达、岐阳王李文忠、江国公吴良和海国公吴祯等。他们中的一些人也曾在朱元璋剿灭功臣的行动中受到牵连，但能够附葬在这里，终究也是一种幸运。 　　朱元璋去世之后，皇孙朱允炆继位，四年后被燕王朱棣推翻代替。朱元璋立下的许多制度被明朝的后代帝王所继承、发展和完善，对后世产生了深远的影响。他生前曾经那么努力地巩固皇权，希望子孙后代永享太平富贵，但大明王朝终究还是被推翻了，他的许多子孙也都落到极其悲惨的境遇，朱元璋在世时又怎能想到这些呢？