治国务须用忠贤，
不听碎语与闲言。
良言苦口利于行，
转败为胜挽狂澜。
骆秉章把石达开骗进大营，诱而擒之。并宣布道："大清皇帝有旨，发逆罪恶悻天，先行逮捕，听候发落。钦此。"
一八六三年六月十四日，骆秉章命人把石达开、石定忠、黄再忠、曾仕和、韦普成五人，押送到成都。当晚，他调动大军五万，以接管为名，闯进安顺场，把六千多名翼军缴了械。然后，展开了一场惨无人道的大屠杀。六千余人，都惨遭杀害。骆秉章为了毁灭罪证，又下令把尸体抛进大渡河。
一八六三年六月二十四日，骆秉章在总督衙门接到两宫太后和同治皇帝的圣旨："着该督将石逆就地凌迟，毋用解京。"骆秉章谢思，连夜做好了准备。
六月二十五日凌晨，骆秉章穿戴整齐，升坐大堂。寅时初刻，石达开等五个人，满身囚服，披枷挂锁，被带到大堂。骆秉章逐个核对了姓名、籍贯、出生年月日，又逐个验明了正身。接着，手捧判决词，宣布道："查罪犯石达开，现年三十三岁，广西贵县人，客家地主出身。石逆于道光三十年七月，率家族三千余人到金田团营，参加洪逆之拜上帝会，任伪左军主将，诈称天父第七子。次年，又晋封伪翼王五千岁。石逆倡乱多年，流窜于大江南北。曾多次杀官夺府，扰乱民心，穷凶极恶，罪恶滔天。较黄巢、李闯有过而无不及，该逆也供认不讳。不重处则人神共愤，社稷难安。按大清律第一款，叛逆罪之规定，将石逆验明正身，绑赴刑场，凌迟处死。"
骆秉章念到这里，略微停顿了一下，又接着念道："查黄再忠、韦普成、曾仕和三犯，皆发匪之巨魁。罪恶昭著，死有余辜。均验明正身，与石逆同时凌迟处死。又查石定忠，现年五岁，乃无知幼童，按理不应以法从事。然该孩乃石逆之子，贼骨逆胎，绝非善良之辈。为斩草除根，也定凌迟罪，与其父同时受刑。"
骆秉章刚念完，黄再忠就跳了起来，破口骂道："狗官！你们真是满口的仁义道德，一肚子男盗女娼。请问，五岁的孩子犯了什么法，也要凌迟处死？还有比你们再毒辣、再残忍的吗？"骆秉章冲下边一打手势，众番役往上闯来，把五个人按倒在地，打掉枷锁，用绳子捆紧，然后，一声令下，将石达开等押赴刑场。午时三刻，刽子手举起了尖刀……
从石达开离开天京远征的那天起，到他死在成都为止，一共是六个年头。可叹石达开举世的英雄，一生的英名，竟落了个身败名裂的下场。
再说天京的情况。一八五七年六月，石达开负气离京后，给太平天国造成了巨大的损失和威胁，洪秀全懊悔不及。前文书说过，洪秀全曾把天国的军政大权，都交给了安王洪仁发和福王洪仁达。实指望大权不旁落，洪氏掌朝纲。结果，适得其反。不但逼走了石达开，就连在京的文武，对他也产生了反感。洪秀全被迫把他俩贬职，又提拔宠臣蒙德恩为"正掌率"，执掌政权，总理国事。正掌率，这个官职是二千岁，爵同王位。不过，蒙德恩这个人，除了溜须拍马，没什么本领。他是广西平南人，壮族，原名蒙上升，后改名德恩。出身是贫苦的农民，走南闯北，懂得些人情世故，也能写几笔字。道光三十年三月，他加入拜上帝会，随太平军转战各地。永安建国时，被封为御林侍卫，经常在天王左右。于是，他便拿出溜须拍马的绝艺，取得了天王的信任。之后，不断高升，从侍卫摆升殿右右指挥。次年，又摧升殿左七检点。十一月，升春官又正丞相，负责女营事务。后又升赞天燕、赞天安、赞天义、朝长等职。这一次，又被破格提拔为正掌率。
不过，蒙德恩是比较聪明的。他自知没有这个能力，所以，在天王面前，极力主张找几位帮手。洪秀全又任命陈玉成为又正掌率，李秀成为副掌率，李春发为又副掌率，让他们共同管理朝政。怎奈这个尚书出身的李春发，文笔虽好，并无实学。陈玉成、李秀成又是军人出身，带兵可以，对掌政却不入门。而李秀成又闹个人主义，不服陈玉成的支配。所以，这个内阁也是有名无实，把天国管了个一塌糊涂。接着，九江、镇江、吉安三个军事重镇相继沦陷，更加深了天京的危机。
洪秀全仰天叹道："千军易得，一将难求。为将易，当帅难哪！"到现在，他愈加思念石达开了，这才命赖汉英到江西瓷都请援。结果，遭到石达开的拒绝，使他大失所望。
正当太平天国内无佐政之人的时候，有两个奇人先后来到天京，一个是洪秀全早年的密友钱江，一个是他的族弟洪仁玕。
钱江字东平，原是广州"升平社学"的创始人。后结识冯云山和萧朝贵，到广东花县投洪秀全，加入拜上帝会。他建议洪秀全和冯云山去广西传教，自己到浙江原籍去传教。结果，因事机不密，被官府逮捕，定成死罪，后因多方设法，走动人情，花去白银数万，才死中得活，改判充军发配。在伊犁做苦役八年，之后获释，这才长途跋涉来到天京。洪秀全素知钱江才高智广，加封他军师之职，协助陈玉成和李秀成主持军务。
洪仁歼是一八五九年四月二十二日来到天京的。这位三十八岁的中年人，不仅才华出众，而且相貌惊人，是位出色的美男子。细眉朗目，鼻正口方，唇若涂脂，五官英俊，还会说一口流利的英语。
洪仁玕，广东花县人，字益谦，号吉甫，系洪秀全同高祖族弟，才华洋溢，通古博今。可是，他与洪秀全的命运相似，累试不第，连连落榜。道光二十三年，为生活所迫，在乡村塾师。同年，皈依洪秀全的拜上帝会。之后，到清远任教，同时发展拜上帝会会众。
一八五一年金田起义后，洪仁歼才得知消息，马上动身去找洪秀全。结果，不遇空回，又被劣绅告发，几乎入狱。此后，他不敢在家乡呆了。咸丰二年，流落到香港，结识了瑞典巴色会教士韩山文。二人一见如故，结成密友。经他口述和引见，韩山文写成《太平天国起义记》一书。一八五二年洪仁歼回国，再次投奔洪秀全，又没成功。一八五三年返回香港，受韩山文洗礼，在西洋牧师处教书。在此期间，他刻苦攻读英语，翻译和阅读了很多西洋书籍，致使他眼界大开，知识丰富。
洪仁玕身在异乡，怀念故土，一八五四年又返回上海，谋往天京。结果，又告失败，只好再次回香港教书，并担任伦敦布道会的布道师。
一人五八年六月，洪仁玕再次离香港北上，由广州经甫雄、梅岭，至江西饶州，转湖北黄梅。历尽万苦干辛，终于在一八五九年四月二十二日来到天京。
洪秀全以隆重的典礼，欢迎这位同族兄弟。当晚，他俩促膝谈心，抵足而眠。秀全见仁环胸怀大志，腹有良谋，加封他为"干天福"之职。三天后，又封义爵，加中军主将。先后不到二十天，洪仁牙竟一步登天，成了太平天国的第二号领袖。
洪仁玕没有辜负天王的重任。他先着手整顿朝纲，任人为贤，提拔和重用了一大批军政人员，如：提升杨辅清为中军主将，黄文金为定南主将，李世贤为左军主将，刘官芳为右军主将，陈坤书为求天义等等。
洪仁玕还主张政治革新，在他任职后不久，便入宫说服洪秀全："天国几经动乱，元气大伤。官场舞弊成风，官兵斗志涣散。致使人心不一，团结不固，普遍存在'结盟联党'的坏风气。"洪秀全点头称是。洪仁玕又说："臣发现，我朝官场中，下有自固之术，私有倚恃之端，外为假公济私之举，内藏弱本强未之弊。臣以为，主公要随时发现人才，重用人才，及时封赏有功人员，不必吝惜王位与要职。只有这样，当臣子的才能心悦诚服，为天王效忠，为天国尽命。""好，爱卿言之有理，朕立刻着手就办。"
在洪仁环的建议下，李世贤封侍王，蒙德恩封赞王，杨辅清封辅王，林绍璋封章王。同时，又严惩了一批贪官污吏，加强了中央领导权。
洪仁汗还写了《资政新篇》，交洪秀全批阅。这部《资政新篇》的基本内容，就是洪仁玕根据他的所见所闻，向天王条陈的治国立政方案。
洪秀全同意了洪仁玕的谏议，并传旨刻印发行，准备逐步实施。
自从洪仁玕掌政后，洪秀全几乎是言听计从。文武大臣发现，干王是个和蔼可亲的人，各方面都给予支持和协助。所以，天京的政局开始稳定下来。
洪仁玕并不是个自私揽权的人。他深知肩头的担子太重，主张让贤。在他的倡议下，洪秀全才第二次派赖汉英向石达开请援。结果，又遭拒绝。从此以后，上至洪秀全，下至普通的军民，彻底把石达开放弃了。
一八六○年，清政府再次派兵，恢复建立了江南大营。清兵十多万，将天京三面包围，形势十分紧张。洪仁玕看到，不拔掉这个钉子，天京随时都会丢掉。为此，他在天京召集将领，共议军情。参加的有：英王陈玉成、忠王李秀成、侍王李世贤、赞王蒙德恩、章王林绍璋、辅王杨辅清、定南主将黄文金、大将林启容、军师钱江、女军师洪宣娇、苏三娘、国舅赖汉英，又副掌率李春发、猛将刘官芳等三十六人。
议论的中心，就是如何攻破江南大营，有人主张硬打，有人主张使反间计，还有人主张夜袭。真是各抒己见，畅所欲言。
洪仁环最后说道："据我所知，清妖的江南大营，是由六省十九府的十五万大军组成。大帅是清妖的钦差大臣和春，副帅是凶悍的叛徒张国梁。之下，还有战将三百五十二名，实力不为不厚。我军虽有四十多万，然而分守各地，很难集中。能直接参预这次战斗的，最多不过五六万人。敌众我寡，相差悬殊，没有必胜的把握。"洪仁玕一字一句他讲着，众人都屏息宁神地静听。略停片刻，洪仁玕又说道："正因为敌众我寡，所以，不能采用硬拼和强攻的战术。和春、张国梁之辈，都是咱们的死敌，收买和离间都是无济干事的。方才，我和钱军师想了个办法。大家看--"说着，把地图展开，众人全都围了过来，洪仁玕用手指着地图说："这是天京，这是敌江南大营。我们欲解天京之围，力攻是不可能的。必须向清妖兵力薄弱的太湖、杭州进攻。清妖无力抵御，必调江甫大营的兵马去增援，待彼撤兵远去，我军迅速返回，用全力围攻大营，必获捷报也。"众将彼此看看，不住地点头赞同。
军师钱江说道："干王所定的战法，切实可行，望各位兄弟一体遵行！""是！"众将同声回答。洪仁玕说："我是军事上的门外汉。如有不当之处，还望各位指教。"说着，把眼光落到李秀成脸上："忠王听令。""有！""你率领大将谭绍光、陆顺德、陈炳文、吴定彩，精兵一万五千名，攻打杭州。记住，一定要狠狠地打。只有打疼了，他们才能向和春请援。待江南大营的援兵到达杭州后，你虚晃一招，马上回师，从溧阳、句容，直趋凉化镇、紫金山。""遵令！"
洪仁玕又叫道："英王听令。""在！"陈玉成施礼，等候分派。洪仁玕道："你率大将吴如孝、刘玱琳、高风谷、丁建勋及马步精兵一万五千，出浦口虚攻滁州。也要狠狠地打，让清妖以为我们要西取安徽，把清兵牢牢地吸引在皖南。而后，迅速撤兵，自全椒南下，经东、西梁山渡江，经江宁镇直趋板桥、头关、善桥。待接到本王的大令后，立刻向江南大营进军。""明白了。"陈玉成归座。
"杨辅清听令！""在！"辅王躬身领命。洪仁环吩咐道："你和黄文金将军，率精兵一万，假意西攻全椒和安庆。听到英王回师的消息后，你们也要马上回师，从高淳、傈水直趋袜陵关，到雨花台待命。""是！"杨辅清和黄文金同声回答。
干王又把侍王李世贤叫到跟前，分派说："你率本部人马，先配合忠王攻打杭州。待忠王回师后，你的人马要从溧阳、常州、金坛、句容，直趋天京北门洪山，燕子矾，原地待命。""遵令！"
"刘官芳、陈坤书二位兄弟听令。""在！"二将站起领命。洪仁玕道："你二人可领本部人马，攻打马鞍山。只求平，不求胜。而后自溧阳北上，直趋高桥门。""知道了！"二将归座。
洪仁玕转回身来，对蒙德恩和赖汉英说："烦劳二位，把九门御林军训练好。待我军向大营发起猛攻时，你们从七桥瓮、上方门、安德门分路出击，配合各大军共破大营。""干王放心，我等记住了。"
钱江补充说："没有被分派的各位兄弟姐妹，仍守原职，听候调动。千万要记住，咱们不要棋胜不顾家。望诸位一定把天京保护好，把天王保护好。""明白了！"众将回答。
干王最后说："这次大战，一定要胜，而不能败。胜者可以扬天威、震士气，我天国则中兴有望；相反，将会前功尽弃，后果不堪设想。"说到这里，他把话锋一转，威严地说："本主将受天王重任，执法如山，决意一扫过去军中存在的弊病。不论是谁，胆敢擅离职守，不听调动，一定严惩不贷！"众将领命，分头行动去了。
一八六○年一月二十八日，忠王李秀成起队先行，自浦口出发前往芜湖。二月十日至南陵，然后自皖南入浙江省。二十四日攻占广德州，留陈炳文守城。二月二十九日占安吉，三月五日攻占长兴。这时，侍王李世贤的大队也赶到了，配合李秀成攻打湖州。一路旗开得胜，每战必克。军威大震，所获胜利品极多。李秀成又用了一计，假冒清军旗帜号衣，沿莫干山东麓自妙西、武康进袭杭州，把沿路的清军哨卡都骗过了。
三月九日，太平军先锋队摸到西湖山中。十一日，猛攻杭州城西的钱塘门和西北角上的武林门。清军大惊，飞报浙江巡抚罗遵殿和杭州将军瑞昌。
罗遵殿是个有名的贪官。据说，他花了五十万白银，走恭亲王奕沂的门路，从一个三品道员，爬上了浙江巡抚的高位。到任后，他根本不懂什么叫治国安民，而急于把他花掉的老本捞回来。此外，他就知道宿柳眠花，过他的糜烂生活。瑞昌倒有点军事经验，总统军权，守把杭州。不过，他万没有料到，太平军会一下子飞到他的杭州来。这天，他和罗遵殿正在将军府看戏，突然接到警报，把他俩吓得一蹦老高。连衣服都来不及换，就爬上了城头。他们手扒垛口往外一看：但见红旗红帜、红号衣、红中、红穗、红腰带，简直跟一片红云似的，聚集在城下。炮弹横飞，矢箭如雨，杀声动地，猛似虎狼，把罗遵殿吓得屁滚尿流。
瑞昌勉强抽出宝刀，拼命叫喊道："守住，一定要给我守住。快，快把老百姓给我抓来，协助官军守城！"
清军仗着杭州城池高大，不易攻破。李秀成在阵地前，商讨攻城的办法。大将谭绍光道："千岁可领兵在这儿继续攻城，把清军都吸引住。卑职另领一军，绕路攻打清波门，杀他个首尾难顾。您看如何？""好！"李秀成拨给他精兵一千二百五十人，炸药数十担，在夜幕的掩护下，绕到清波门。
谭绍光先查看了地形和城上的设防情况，看样子守兵不多。忙命人挖地道，准备用地雷破城。紧张的工程开始了，一支二百人组成的掘子军，以极其熟练的技术，迅速把地道挖到城根下，又过了片刻，终于把洞穴掏成，几十担炸药都填到洞里，把导火线引到外边。谭绍光马上命人向忠王禀报，李秀成大喜，急令谭绍光引火。谭绍光把军兵撤到三百步以外，传命引火。霎时间，发出了天崩地裂的两声巨响。
