完成Apple IIc鼠标后，沃兹涅克领导了一个野心勃勃的项目，代号为Apple IIx。该项目以Western Design Center的65816处理器为基础，该处理器与Apple II中的6502处理器向后兼容。Apple IIx还配有第二个处理器插槽，这样它就能运行IBM PC和Macintosh软件。不过，1984年3月该项目被毙了，因为Western Design Center不能及时生产出芯片，乔布斯坚决反对允许Apple II产品线蚕食已被Macintosh占有的市场份额。由于没有什么实际的工作需要做，沃兹涅克再次在苹果公司内部漂来漂去。享有盛名的地位给他带来无休止的干扰，如电话、爱好者的邮件、演讲活动。他抱怨“开不完的会”。苹果公司的官僚作风挫伤了他的积极性，但是更让人气愤的是公司忽视他的孩子——Apple II产品线，希望它死掉并退出市场。　　1985年股东大会后，史考力激动的电话终于让沃兹涅克难以抑制的怒火爆发了。一向温和的沃兹涅克向CEO发火说道：“作为三大股东之一，我想让你知道我非常生气，Apple II小组中有许多人也很气愤。这些为Apple II工作的人整天听到的都是‘Mac，Mac，Mac’。看到他们士气低落，我也受到伤害。今天早上我来上班时，工程师、管理人员和秘书都已准备提交辞呈，他们对此非常愤怒。给股东的印象是公司所有的收入都来自Macintosh。”史考力试图安抚沃兹涅克，但是不能。2月6日，苹果公司宣布沃兹涅克想再次去做其他感兴趣的事。苹果公司的公关人员努力给他的离开发出积极的信息，坚持说沃兹涅克作为工程顾问继续留在花名册上，年薪20 000美元，但是沃兹涅克公开严厉批评管理层在Apple II产品线创造公司70%收入的情况下却支持Macintosh。
　　离开公司时，沃兹涅克拥有苹果公司4%的股份，估计价值7 000万美元。他迅速以每股30美元抛售大批股票，用其中500 000美元与苹果公司的同事工程师乔?埃利斯(Joe Ennis)成立了一家新公司。他们的新公司最初叫MBF Incorporated。大写首字母代表“My Best Friend”，因为沃兹涅克希望自己的新产品是生动有趣、方便使用的家用电器。MBF迅速更名为CL9(Cloud Nine的缩写)，由于他们正在制造一种控制音响和视频消费电子产品的设备。沃兹涅克不必等多长时间，就可以报复乔布斯让他痛苦地离开苹果公司。　　3月17日，在加州的坎贝儿访问Frog Design(http://www.frogdesign.comPfeifer必须停止为CL9公司工作。由于苹果公司是Frog最大的客户(1982年，公司创建了在Apple IIc上使用的Snow White设计语言)，其老板Hartmut Essinger别无选择，只好接受乔布斯的要求。乔布斯否认这是出于某种个人动机，他说：“我们不想看到自己的设计语言在其他产品上使用。”但是，却有其他的看法。“史蒂夫 ?乔布斯恨我，可能是由于我讲过有关苹果公司的事情。”沃兹涅克这样告诉《华尔街日报》。　　沃兹涅克离开苹果公司后仅7个月，乔布斯自己就因为与史考力在会议室的争吵中败北而辞职。这样苹果公司历史上第一次没有一个创始人，增长缓慢的Macintosh销售让人们看到苹果公司正在走向衰落。乔布斯开始以低廉的价格抛售他所持有的苹果公司的大量股票。而与此同时，沃兹涅克却在12月回购价值500万美元的股票，并宣布计划再购买1 500万美元的股票。沃兹涅克当时这样说：“这不是投资，只是这样做是对的。我非常喜欢苹果公司，员工士气高昂，公司的产品在朝正确的方向发展。”购买股票后，沃兹涅克大约拥有750 000股苹果公司的股票，当时的交易价格为20美元/股。
　　最后，沃兹涅克从伯克利大学获得了他的电子工程科学学士学位，毕业典礼于1986年5月17日举行(差几个学分，他差点毕不了业，但是鉴于他在苹果公司的工作，等价地给了他几个学分)。致告别辞时，他告诉自己的同班同学：“幸福是人生的惟一追求。除非你认为你可以更幸福，否则不要购买计算机。不要做与追求幸福无关的事情。你每天挂在脸上的微笑次数是度量生活质量的惟一标准。幸福需要食物、快乐和朋友。”　　遗憾的是，沃兹涅克再次放弃了物质的幸福。1987年4月30日，沃兹涅克提出与克拉克离婚，称他们之间的分歧没法协调。他努力争取并同意与克拉克共同拥有对孩子耶西 ?约翰(Jesse John)和萨拉 ?纳丁(Sara Nadine)的监护权(他们的第三个孩子小斯蒂夫 ?加里(Stephen Gary Jr.)在首次提出离婚后7个月才出生)。