1. 第二次西航
费迪南和伊莎贝拉敦促哥伦布尽快开始第二次西航，他们想通过殖民的手段巩固对伊斯帕尼奥拉的主权，同时进一步拓宽统治的区域。他们急不可待了，因为据报告葡萄牙国王约翰二世正在装备一支船队准备西航。只是因为西葡两国划分势力范围的问题正在巴塞罗那通过外交途径进行谈判，葡王才把他的队伍的出发日期推迟了两个月。葡萄牙建议，加纳利群岛以南的所有新发现的土地归属他们，而此岛以北属于西班牙。西班牙反对。争执提交教皇亚历山大四世裁决，此人本身就是西班牙人，而且是依靠了费迪南和伊莎贝拉的影响力才在最近的一次选举中登上教皇的宝座。
为了加快事情的进行，国王和王后指定塞维利亚的副主教唐·胡安·德·方塞卡与哥伦布共同负责第二次西航的组织工作。由于有了国王的支持，此次航行的准备工作得以顺利进行。地点选在加的斯港。加的斯城建立在大陆伸入海洋的一个小小半岛的尖端上，三面临海，是西班牙南边一个重要的港口。这一次的远航从规模和人数上都远远超过第一次。第一次费了几个月的时间才凑齐三只船，其中两只还是惩罚性地从帕洛思强行征集的；而这一次的船队拥有了十六条船只。第一次费尽心力勉强招募了90名船员，其中还有从监狱中释放的囚犯；这一次1200人中有200人都是有身份有地位的贵族子弟，他们自己支付路费，想在这一次探险中建立功勋。他们都是骑士，携带着武器，准备着去征服，随时都可以投入战斗。除了船员以外，还有一大批平民百姓，包括殖民地开拓者、淘金者、种地人、工匠、学问家。还有马匹、奶牛、鸡、羊、种子、植物。装了足够往返六个月吃的粮食以及大批供移民使用的农具……这支舰队的规模和气势似乎可以配得上他海洋统帅的头衔了。
船队中的重要的人物是安东尼奥·德·托雷斯，他的姐姐是唐·胡安王子的保姆。此人深得国王们的信任，不少皇家仆从跟随他参加这次远征。这些人反对权威，不接受任何约束，热衷于冒险。在这些人当中，应当提到的是阿隆索·德·奥赫达和莫塞·佩德罗·马尔加里特。奥赫达是梅迪纳塞利公爵的仆从，无论是在卡斯蒂利亚或是后来在新大陆发生的许多战斗中，他都是最勇敢的人之一。至于莫塞·佩德罗·马尔加里特，哥伦布曾多次把最危险最困难的任务交给他，并请求国王奖赏他。船上还有一位来自塞维利亚名叫海昌的大夫。他不仅是远征队面临严重疾病时的医生，而且是一名合格的考察动植物的自然科学家。参加第二次西航的人中有第一次的参加者胡安·德·拉·科萨（擅长绘制海图）。还有佩德罗·德·拉斯·卡萨斯，他的儿子拉斯·卡萨斯，我们在前面已多次提到他所著《西印度群岛史》和有关哥伦布的生平和传记。还有阿隆索·桑切斯·德·卡拉瓦雅，是巴耶札的市长，他是哥伦布的好朋友。还有胡安·朋思·德·莱昂，是他后来征服了波多黎各，发现了佛罗利达。还有弗朗西斯科·德·彭尼亚洛沙，负责指挥船队的武装力量。还有米歇尔·德·库尼奥，他也是哥伦布的好朋友，来自哥伦布的家乡热那亚。据估计参加此次西航的人数在1200～1300之间。平松家的人避不参加此次航行。尼尼约家有4人参加。其余的多数海员同第一次一样主要来自韦尔发及其附近地区。
1493年6月，哥伦布又来到塞维利亚，在埃斯特雷马杜拉山区的瓜达卢普修道院进行了朝拜，完成他返航途中遭遇暴风时许下的心愿。途经科尔瓦多时看望了贝特丽丝，并把两个儿子迭哥和费迪南也带到了塞维利亚。与此同时他写信给他仍在法国居留的大兄弟巴特罗缪，和还在热那亚干羊毛纺织的小兄弟迭哥，告诉他们西航成功的消息，要他们也来参加今后的航行。小兄弟迭哥从热那亚及时赶来。他是一个诚实的人，谨慎朴实，善良温和，可惜的是这些优点没能使他成为一个优秀的领导人，无力承担落到他肩头上的重任。巴特罗缪比他更为成熟，做事很有魄力，可惜的是来晚了一步。当他赶到加的斯时，船队已经出发航行了好一段路程。
根据费迪南和伊莎贝拉1493年5月29日发出的训谕：第二次远征的首要任务是教育和改造土人，让他们皈依基督，为此目的远征队配备了五名传教士，由本笃会修士弗雷·贝纳多·布伊尔带领，指示哥伦布“尽可能以善良而慈爱的态度”对待印第安人。第二个任务是考察古巴，确实弄清它是不是通往中国的大陆，或者只是一个岛屿。
哥伦布受命担任“大船队的总指挥”，有权独立处理殖民地的行政事务。但组织工作完全由他的朋友塞维利亚副主教唐·胡安·德·方塞卡主持。7月初，哥伦布到达加的斯。方塞卡的准备工作做得很出色。国王和女王命令安达卢西亚地区所有行政官吏向方塞卡提供一切方便。
但在哥伦布和方塞卡之间很快便发生了龃龉。哥伦布要求带领一批属于他个人的随从人员，方塞卡认为多余。哥伦布越过方塞卡将此事提交国王和王后以后他个人的要求得到了满足。
以后的一段时间里，哥伦布大部分精力都放在加的斯，干预方塞卡已经办得很好的组织工作的每一个细节。他们之间的争执越来越多。哥伦布在方塞卡租的船、雇的人、订的货等等事情中总能挑出些毛病。
哥伦布的旗舰是船队中最大的一艘，载重200吨，正式名称“圣·玛利亚”号，诨名“玛利亚加朗特”号。另外两条船吨位和它差不多，一条叫“柯林娜”，另一条叫“加列加”。另外14条全是轻便快帆船，其中一些可用于到达“印度”后的内河航行。立了大功的“尼尼亚”号经过维修保养也要参加第二次的西航。
此次招募海员不费吹灰之力，应征人数超过定额两倍。哥伦布的任务是从其中选拔最合适者。他的选择有时并不完善，其中有的贵族子弟完全是一帮纨绔儿，他们一贯游手好闲，只把这次西航当做休假旅行，梦想着返回时可以带回大量的金银珠宝。
船队即将出发时，谣传葡萄牙国王约翰二世已经向西派出一支船。西班牙就此提出抗议，葡王称他对此事全不知情。但费迪南和伊莎贝拉却将此事看得很重，他们指令哥伦布在航行中密切关注此事，如在西班牙的水域中确有葡萄牙的船只一定要加以狠狠的惩罚。
9月25日，船队从加的斯出发，举行了盛大的欢送仪式。
紧接着的第二天，教皇亚历山大四世就西葡两国的争端发布了一道诏书，实际上把向西边和南边航行已发现和未发现的全部陆地和岛屿都划归给西班牙。约翰国王提出抗议认为对葡萄牙太不公平。之后进行了繁忙的外交交涉，结果西葡两国都置教皇诏书于不顾。他们在1494年6月7日在托德西拉斯签订了一份划分势力范围的条约才使两国间避免了严重的冲突。条约规定：在佛德角群岛370里格处从北向南划一条分界线，西边属西班牙，东边属葡萄牙。
哥伦布率领的船队出发时天气晴好，他们直驶加纳利群岛。才过10天，10月5日，他们在戈梅拉岛的圣·塞巴斯蒂安港停靠。补充给养，又带了一批猪、牛、羊和家禽上船，准备到新的地方繁殖饲养。到了10月13日，趁着东南风，船队朝着西偏南的航向行驶。哥伦布明白这条路线很快将把他们带到伊斯帕尼奥拉南边，但在航行途中都又想考察和探索在第一次航行时土人告诉他的加勒比的一些别的岛屿。为了防止别的船失散，他把如何到达伊斯帕尼奥拉和纳维达德的指令密封好以后分发给各位船长。实际上，没有一条船失散，除了途中遇到的一次暴风雨外，整个航行十分顺利。
11月2日晚间，哥伦布十分有把握地肯定快要到达陆地，为了避免夜间航行绕过就要到达的地方，他下令卷帆。哥伦布采用的航位推算法十分精确，第二天黎明时分果然看见出现了高山耸立的岛屿。旗舰上的全体人员聚集到后甲板上，高唱赞歌，齐声祷告，感谢上帝保佑他们如此快捷如此平安的航行。那一天是礼拜日，哥伦布为这个岛命名为多米尼加，在拉丁文中，多米尼加为主日，即礼拜日。不久又发现第二个岛屿，没有高山但林木茂密。哥伦布用他的指挥船名为此岛命名：“玛利亚加朗特”。到了中午又发现四个岛屿，其中较大的一个岛，哥伦布命名为玛利亚·德·瓜达卢普。是为了履行自己对瓜德罗普修道院僧人所许下的诺言，哥伦布给这个岛取名圣·玛利亚·德·瓜德罗普岛。此次航行出发前，哥伦布曾经去过这间修道院还愿。后来人们简称为瓜德罗普岛。虽然玛利亚加朗岛没有港口，船队在其避风面抛锚过夜。第二天，哥伦布令人在这些岛屿上竖起十字架，以国王和王后的名义举行了占领仪式。第二天，在瓜达卢普岛南岸登陆，土人见状四散奔逃。哥伦布派迭哥·马奎斯率领一个十人的武装小分队向岛内进发。
又过了一天，小分队没有回来。哥伦布十分不安，又派了四个分队出发去找寻，每队50人。这些人没有找到前日派出的小分队，却在居住着加利布人的各个林子里发现了准备下锅的人的躯体。他们解救了一批讲阿拉瓦克语的奴隶，男女都有。其中男人经过阉割后养肥作为美味佳肴，女的则用于生育女繁殖后代。从这个部落的名称产生了“吃人生番”（Cannibal）这个新词。
人们担心第一次派出的小分队可能已经遇害，说不定已被吃掉。然而四天过后，他们忽然间又回来了。这些人疲惫不堪，饥肠辘辘，但却没有受到伤害。他们叙说是在丛林深处迷了路。这个岛上没有黄金，但风景秀丽，土壤肥沃却使西班牙人赞不绝口。这里还有成群的色彩绚丽的鹦鹉。白人在这里第一次尝到了菠萝的滋味。
11月10日，船队启锚航行。哥伦布下令将所有的独木舟全部销毁，以防加里布人袭击伊斯帕尼奥拉，抢劫奴隶。那些被搭救的阿拉瓦克少男少女都留在船上同行。此外还有几个俘虏来的加里布人。
离开瓜德罗普岛以后，船队趁顺风或侧面风沿小安的列斯群岛的背风岸前进。这里风景如画，加勒比海的海水在不同的深度变幻着绚丽多彩的颜色。每一个岛屿都是一座高高耸立的峰。一连几天，哥伦布差不多把所碰到的每个岛屿都加上一个圣·玛利亚的名字，以至后来造成混淆。
船队继续前进，哥伦布先后给一些岛屿按照他的方式命名：圣·玛利亚·德·蒙特塞拉特岛，圣·玛利亚·拉·列当达岛，圣·玛利亚·拉·安提瓜岛，圣·马丁岛，圣·克鲁斯岛，等等。哥伦布的船队没有在圣·克鲁斯岛久留，朝北方航行，发现了越来越多的岛屿。哥伦布按照典故中的传闻给它们取名为“1.1万个贞女群岛”，即维尔京群岛（VirginIs）。以后又陆续发现圣·托马斯岛。
11月14日，西班牙人和加里布人发生了第一次武装冲突。当船队在圣克鲁斯岛外停靠时，一个25人组成的队伍上岸取水。在一个看似无人居住的村落里发现了一批年轻的男女奴隶便解救了他们，然后带着他们回船。这时载着4男2女和一个男孩的独木舟突然冲出来，这些人手执弓箭袭击西班牙人，两人中箭负伤，其中一人后来死去。西班牙人反击，杀死一些，俘虏一些。其中一个女人被库尼奥捕获，哥伦布允许他留用作为奴隶。此女年轻漂亮，赤裸着身子。而那些男人外貌十分凶恶和残忍。
5天以后，船队来到一个大岛，整天沿着岛的南岸航行。哥伦布把它叫做“圣·胡安·巴蒂斯塔”（施洗者圣约翰），在今日的地图上此岛名称是波多黎各。在此停靠两日，补充淡水和食物。11月22日，船队通过分隔波多黎各和伊斯帕尼奥拉的海峡。
虽然哥伦布想急于到纳维达德了解他上一次留在那里的人和城堡的现状，但他认识到需要寻找一个更好的地方作为永久的定居点。11月25日，船队在蒙特·克里斯提港停泊，哥伦布派出一个分队上岸寻找一个理想的地方。这些人回来说这样的地方没有找到，倒是发现了两具被肢解了的人体，第二天又发现了两具，其中一人还蓄有唇须。哥伦布担心这是四个被杀害的西班牙人。显然他的担心不无道理。
11月27日夜，船队到达纳维达德，天黑无法进港。下令鸣炮但岸上毫无回应。哥伦布知道情况不妙。夜间一些土著人驾着独木舟出来但不愿靠近哥伦布的指挥船。哥伦布举灯自报姓名，这时才有一个土人首领上船，他是瓜卡纳加利酋长的堂弟。据他说留守纳维达德的人，有的死于疾病，有的死于械斗，其余的安然无恙，完好无损。
哥伦布在这次远征中，发现了20个大岛和40多个小岛。作为船队总指挥，他的工作是出色的。
2. 殖民者凶相毕露
第二天一大早，哥伦布派出一支队伍探听虚实。他们看到的是瓦砾废墟、残垣断壁，到处都散落着烧焦的木头。一片残破景象。
经过进一步询问，瓜卡纳加利酋长的堂弟才说，西波地区的加里布酋长卡奥纳波前来进攻，杀死了守塞的人，瓜卡纳加利本人在保卫战中也受了伤。
哥伦布决心弄个水落石出，带着100人，其中包括医师海昌，前往瓜卡纳加利的村庄。当海昌揭开酋长的绷带时发现并没有什么伤痕，但酋长仍然坚持说卡奥纳波的袭击确有其事。教士布伊尔催促哥伦布将瓜卡纳加利处死，哥伦布没有同意，认为应当采取“怀柔”政策。
通过他这次带来的印第安人翻译与当地土人的交谈，哥伦布才了解到事情的原委。一年以前，当载着哥伦布的“尼尼亚”号刚一离开，留下的西班牙人便露出凶残的本性，他们到处抢夺黄金，绑架、奸淫印第安妇女。由于分赃不均，争夺女人，内部发生激烈火拼，城堡秘书埃斯科维多联合皇家御厨瓜特里尔，杀死金匠哈孔德，结成团伙，为非作歹。
一批人闯入一个印第安部落抢掠，遭到酋长卡奥纳波率领的土人的抵抗，结果全部送了命。卡奥纳波为了彻底铲除纳维达特这个毒瘤，带着队伍深夜来到营地，发现留守的西班牙人正在强迫抢来的许多印第安妇女供其淫乐，愤怒之下，把这些西班牙人斩尽杀绝，有的人被赶入海中淹死，有的躲入树林中也未能幸免，被一一搜查出来，结果了性命。将纳维达特整个营地付之一炬。
瓜卡纳加利在这场突然袭击中确实是站在西班牙人一边的。他受了一点伤现已接近痊愈。他的部下身上还带着伤痕。
从此以后，西班牙人和印第安人的关系急剧恶化，哥伦布花了很大的力气，甚至不惜以判处死刑相威胁，才暂时阻止了新的流血冲突的发生。
但是冲突是不可避免的。哥伦布第一次西航来到这里就已经种下了祸根。哥伦布远征的目的就是为了占有和征服所发现的土地，包括在这些土地上的人，夺取他们想象中的大量黄金。当他发现土著居民淳朴善良即意识到这些人很容易被管束、被驱使作为奴隶使用。这和葡萄牙殖民主义者在非洲抢夺贩卖黑人奴隶如出一辙。哥伦布第一次远航抓走的六名印第安人便是他作为战利品带回西班牙的，这就开了一个十分恶劣的先例。虽然西班牙天主教徒国王给这些人施行洗礼，给予了一定的待遇。不过是为了以上帝的名义，用宗教的外衣把他们奴役印第安人的罪恶行径略加粉饰而已。
哥伦布第一次到达美洲在与泰诺人初步接触以后就有了奴役他们的完整的计划。他在呈送西班牙国王看的《航海日记》中这样写道：“两位陛下可以相信……这个岛屿以及其他一切地方都同卡斯蒂利亚一样是属于两位陛下的。这里除设置一个殖民地以外其他什么都不需要，您们可以指挥他们去做您们将要做的一切事情。因为我率领船上这些为数不多的人员就能够走遍这里所有海岛而未曾遇到阻碍。我已经看到，我仅仅派三个船员上岸，那里无数印第安人都只顾四处逃散，没有一人敢向船员们为非作歹。他们没有武器，没有自卫力量，他们是这样胆小怕事以至上千人不能对付三个人。由此可见他们适于俯首听命，适于受迫工作，适于播种以及做我们需要做的其他任何事情。这样您们就可以叫他们建设城镇，教他们穿着衣裤以适应我们的风俗习惯。”①
① 《哥伦布传》（上卷）［美］塞·埃·莫里森著，陈太先、陈礼仁译，商务印书馆，1995年版，第405页。
拉斯·卡萨斯对哥伦布这些话作了如下的评论：
“这时请注意，印第安人这种天真淳朴和友好的高贵风度和他们的谦虚作风以及他们缺乏武器、缺乏自卫力量的情况，使得西班牙人对他们傲慢无礼、目空一切，并且把自己找得到的最苛刻最艰苦的工作强迫他们去做，使他们饱受压迫和面临灭亡之灾。的确，这里哥伦布用语言过分夸大自己，他在这里所设想的和他嘴里讲出来的，就是他后来使印第安人蒙受暴虐待遇的开端。”①
① 《哥伦布传》（上卷）［美］塞·埃·莫里森著，陈太先、陈礼仁译，商务印书馆，1995年版，第405页。
3. 美洲的第一个殖民地
12月7日，船队向东行驶，寻找一个可以安身的地方。之后三个礼拜一直刮着强劲的顶头风，船队只好在离蒙特·克里斯提以东大约30英里的一个半岛的背风面停泊。虽然在这里建设城镇并不理想；虐蚊遍地，水源缺乏，港湾不便停泊。远征队员们也不愿长期在水上飘泊，动荡不定的生活使他们厌倦。哥伦布决定在这里上岸。好在岛上土壤肥沃，可以种植。
人、给养、武器和牲畜都上了岸。规划了街道和广场。建立了临时草屋。石匠们开始修筑一间教堂。为哥伦布专门修了一所住房。种植了树木和作物，包括从西非带来的甘蔗和葡萄，以便酿酒。哥伦布把这座新城命名为伊莎贝拉以纪念王后。
建城伊始就有了麻烦。带来的食物一天天减少，牲口成批死亡，农作物种子霉烂。许多人，包括哥伦布自己；身患疟疾，或因水质和食物中毒染上了各种疾病。据海昌的统计病人数在400以上。为了加快建设城堡，哥伦布命令“骑士们”——那些贵族子弟干活，引起了他们的极大反感和对抗。哥伦布规定，对拒绝干活的人停发口粮，引起了强烈的敌对情绪。
为了减少租船费用，哥伦布本想当大多数船只卸下货物后把船员都遣返回西班牙。但他又不愿意让这些船空舱回去，他想载回一些黄金至少可以偿还一部分远征费用。土人告诉他说西波的金矿离此地不远。1491年初，登陆之后不过几天，哥伦布派遣阿隆索·德·奥赫达带着20来人再加土人作为向导去探明金矿之所在。因为要经过卡奥纳波的领地，派出的人个个全副武装，准备应付不测事件。
在穿过一大片茂密的丛林、翻过一个山梁之后，人们发现了一片宽阔富饶的山谷。使他们放心的是卡奥纳波并没有出现，而当地的土人对他们友好而又合作。没有发现金矿，但从周围许多山峰上泻下谷地的溪流中肯定有大量的金砂。
奥赫多只用几天时间就弄到了不少的黄金，然后带着几个人急忙赶回伊莎贝拉。他把他的副手吉内·德·戈巴兰留下，管束其余的人。戈巴兰深入内地，为他自己搞到不少黄金，然后在一月底也赶回伊莎贝拉。
哥伦布对他们的发现很高兴。他们带回的黄金数量虽然有限，但却唾手可得。他向西班君主报告说：“河流如此众多，其中黄金亦多。”2月2日，12艘船在安东尼奥·德·托雷斯率领下动身返回西班牙，只留下玛利亚·加朗特、加列加、尼尼亚和另外两条较小的帆船。船队除了装载着黄金外，还有肉桂、胡椒、檀香木、鹦鹉和一批从各个岛上挑选出来的土人，包括其中三名加里布人，这些人到达西班牙时存活下来26名。
哥伦布将致西班牙君主的信委托托雷斯面呈，在信中他请求国王将3到4条帆船尽快派回，让其带来急需的粮食、医药、酒、衣服、武器和铠甲。他还请求派一些熟练的金矿矿工、驴子和骡马来。他惟一的抱怨是骑士们不会干活。经过四个多礼拜的航行后，3月7日船队平安到达加的斯港。
3月12日，哥伦布将伊莎贝拉城交给他的小弟弟迭哥管理，自己带着一个庞大的探险队沿着奥赫多等人走过的路线深入内地。这是一支有400人的队伍，有步兵、骑兵，还有一帮工匠。士兵们穿带着全幅盔甲，擎着各色各样的旗帜，马匹都披着绚丽的毛毡，又是吹号，又是击鼓，尽量招摇过路。哥伦布有三个目的：一是向土人抖抖威风；二是要在西波地区建立一座碉堡；三是找到金矿进行开发。
在第一座山梁上，哥伦布俯瞰下面是一个富饶而又美丽的山间谷地。他派遣的先头队伍就来过这里。高兴之余，他称它为“皇家平原”。这里土壤肥沃、水源充足而且人口稠密。哥伦布的大队人马经过时，每到一个村庄，诚惶诚恐的土著居民迎接他们，献上食物和金砂。谷地再往前是中央山脉，奥赫达一行人就是在那里弄到黄金的。到了这里已是3月16日，哥伦布下令在此停歇，他选择了一个地方下令立即开始修筑城堡。他给取名为“圣·托马思”。
哥伦布在此停留了5天，监督工程的进行。与此同时他派人前往山区侦察，寻找黄金的出处。派出的人回来以后交出了价值约等于今天3000英镑的金块和金矿。有的人暗地里给自己留下一半，结果被发现遭到严刑拷打，落得个皮开肉绽，惨不忍睹。
哥伦布到了这里终于明白西波并非西潘左，但他仍然坚信这里可以找到大的金矿。
哥伦布指派莫塞·佩德罗、马加利特负责管理正在修筑的城堡，并给他配备了356人的卫队。3月21日，哥伦布和其余的人动身返回伊莎贝拉。在他离开的短暂时间里，那里的情况日益恶化。许多病人死去，粮食已经耗尽，士气极其低落，人人都不满意，个个都想尽快回到西班牙去。
仅过一两天，马加利特就派人送信说，卡奥纳波正在聚集他的队伍，准备进攻正在兴建的城堡。为了加强那里的防务，哥伦布急忙向那里派去七十多个士兵。一个星期以后，他又向那里加派了四百余人，由阿隆索·德·奥赫多率领，支援新建的城堡。而马加利特本人却领着一支人马深入岛内进一步探寻。
哥伦布本人此时渴望回到海上去。他指望伊莎贝拉城的管理会逐步走上正轨，于是任命了一个管理委员会。组成人员是他的弟弟迭哥、弗雷·布希尔、佩德罗、费尔南德斯、科龙内尔、阿隆索·桑切斯·德·卡拉瓦雅和胡安·德·鲁克山。4月24日，哥伦布乘“尼尼亚”号船并带着另外两条船：“圣·胡安”号和“卡尔德拉”号出航，此行目的是要彻底弄清，究竟古巴是不是亚洲大陆的一部分，如果是，他企盼有幸面见大汗本人。
此行费时5个月，主要功绩是发现了牙买加。哥伦布两次来到这个地方，一次是5月初，一次是8月中。虽然和古巴以及伊斯帕尼奥拉的土著人同样，都是泰诺人，但牙买加的人却要剽悍得多，也更加好战。哥伦布第一次来此时，船只停泊在一个叫做波多布易诺的港湾。他派人驾小船上岸打柴取水。这些人上岸遭到土著人的抵抗。土人投掷长矛和石块，发射石弓箭，还放出一批恶狗咬伤多人。几个被石弓箭射中的人当场毙命。
可是到了第二天情况忽然起了变化。土人们谦卑地过来献上食物作为礼品，从此这里再没发生过麻烦。当哥伦布第二次来此时，他勘察了这个岛的西岸和南岸。在此期间，他的船受到良好的保护，得到充足的淡水供应。当他就要离开时，土著酋长带着妻子、儿女、兄弟和随从乘独木舟来到“尼尼亚”号船上，恳求哥伦布带他们前往西班牙。哥伦布婉言相拒，他们也就友好地离去了。
在两次探查牙买加之间，哥伦布考查了古巴南岸的大部分地区。一路上也有不少风险。差不多整整一个月时间，船队缓慢地、小心翼翼地在几百个小岛中间穿行。有的地方水很浅，船锚就在海底下拖着行驶，船员们一个也不敢粗心大意，好歹渡过了这么一段艰难的航程。
哥伦布目不转睛地注视着、捕捉着任何足以证明这里就是中国大陆的迹象。当有一个土人告诉他说此地往西有一个叫蛮宫的地方，他不假思索地断定那就是马可·波罗描写过的中国的“蛮子省”。
哥伦布当然不满足于此次出航就这么无功而返，但是面临的困难也很多：食物短缺，船员们日见烦躁不安，船只漏水，急需修理。6月13日，哥伦布认识到航行距离已经够远了。他命令参加此次探险的全体船员签署一份文件，声明他们确信：古巴就是中国大陆的一个半岛。尽管许多土人都告诉他说古巴只是一个岛屿，他根本就不要听。事实上只要他继续再往前航行两天即可到达古巴的最西端，从而证实其的确是一个岛屿。但哥伦布此时需要的恐怕是“自欺欺人”。他命令返航。
返航途中经过牙买加。8月19日离开牙买加，第二天船队到达提布隆海角，海地的西南端。此后五个礼拜遭遇顶头风，船队沿着伊斯帕尼奥拉南岸向东缓慢行驶。在到达一个湾汊处时（此地后来兴建了圣·多明各城），哥伦布命令9个人上岸，要他们抄陆路前往圣·托马斯，通知他的弟弟迭哥，就说他即将返回伊莎贝拉。
哥伦布返回以前策划了一次在波多黎各抢掠奴隶的行动，但未能付之实现。他突然发病，失去知觉和记忆，差点丧了命。船队直接驶向伊莎贝拉，并于9月29日到达。当时哥伦布已经处于昏迷状态。
4. 哥伦布的暴政
当哥伦布从昏迷中苏醒过来，发现自己已经上了岸，使他不胜惊喜的是他的大弟弟巴托罗缪正站在他病床旁边。他回忆起来曾给兄弟写信要他赶来参加这一次远航，但未能及时赶到。后来哥伦布要求国王将他的两个儿子迭戈和费迪南收入宫中为王室服务。国王答应了他的请求。两个孩子是由巴托罗缪带进王宫的。国王答应任命他们担任小王子唐·胡安的伴童。巴特罗缪时年33岁，长得一表人才，英俊而有风度。他在法国的一段经历使他的才能大有改善。国王和王后对他印象极好，指令他率三条船为伊莎贝拉运送给养。实际上他在六月就已经到了这里。
伊莎贝拉和伊斯帕尼奥拉的形势不但没有如他设想的那样；在他离开期间有所改善，相反的情况更糟。哥伦布的主意是让马加利特带一批人深入岛内寻找黄金，结果适得其反。在圣·托马斯得到奥赫达的支援以后，马加利特率领三百五十多人在岛上一连几个礼拜无恶不作：从土人手中抢夺食物和黄金，残酷拷打他们，奸淫妇女，强迫年轻人当奴隶。
这一伙人的胡作非为传到迭哥·哥伦布耳中时，他给马加利特写了一封信，指责他的错误行为。马加利特不但没有收敛，反而带着他的一部分队伍进军伊莎贝拉。他争取了一批反哥伦布的派别站到他的一边，其中就有弗雷、布伊尔神甫。马加利特夺取了巴托罗缪·哥伦布带来的三条船，和他的同党一起径自开船回西班牙去了。马加利特留在岛内的另一帮人又进而分裂成新的团伙。他们更加野蛮地欺凌和杀害土著人，土著人奋起反抗，以其人之道还治其人之身。
哥伦布一旦恢复健康，他采取的第一个行动便是任命巴托罗缪·哥伦布为他的副总督。这更加激起了反对派的不满。尤其错误的是，哥伦布对西班牙人对土著人的暴虐行动采取放纵的态度，而他自己对土著人的政策也变本加厉的严酷。他显然是想用对土著人的战争缓和或转移内部的矛盾。
哥伦布派出一批清剿队伍，骑着马，带着狼犬，深入岛内清剿，经过一场血战，抓获了一千五百多无辜的印第安人，包括妇女和儿童，把他们统统押解到伊莎贝拉来。
这时安东尼奥·德·托雷斯率领4条帆船带着给养来到伊莎贝拉。托雷斯还带来了一封国王给哥伦布的信。此前对哥伦布十分不利的消息也不断传到国王的耳中，但国王和王后仍然表示了对他的信任。他们在信中说：“你当初告诉我们说可以实现的那些事情，大部分都成了现实。”国王还签发了一条命令，要求伊莎贝拉的所有人，包括骑士和绅士必须服从哥伦布的指挥。国王和王后为了加强伊莎贝拉与国内的联系和信息的交流，提出两地之间每月对开一条船。国王和王后同时提醒哥伦布善待印第安人。
安东尼奥·德·托雷斯的船队在港口待命，准备返回西班牙。哥伦布派遣他的小弟弟唐·迭戈与托雷斯同行，返回卡斯蒂利亚向王室进一步说明情况，反击那些造谣中伤他的人，其中包括马加利特和弗雷·布伊尔神甫等。此举收到一定的效果。西班牙国王重新确认了哥伦布的权利，包括他应得的黄金份额。
哥伦布没有多少黄金可供托雷斯的船队带回西班牙去，但却有他的奴隶。他将俘虏来的500名印第安人装上船，准备到西班牙以后作为奴隶出售。此事他特别嘱托迭哥办理。哥伦布这么作更加怂恿了其他人对印第安人的残酷劫掠。
1495年2月24日，船队动身返回西班牙，途中花费近3个月时间，大约200名印第安人死去被抛入大海中。其余的印第安人在加的斯港上了岸但几乎个个都身染重病，气息奄奄，在奴隶市场上都卖不出去。其中的大部分几个月以后先后死去。
在此期间，哥伦布在伊莎贝拉挑起了一场全面的战争。岛上东南部的一个酋长瓜亚提瓜纳集合了上千人的队伍，准备进攻伊莎贝拉。哥伦布知道这个情况以后，任命巴托罗缪·哥伦布和奥赫达做他的副指挥，三人一起率领着200名步兵和20名骑兵前往清剿。在北部山区向下倾斜通向皇家平原的地方，印第安人中了哥伦布等事先周密布置的埋伏，短兵相接，武装精良的西班牙人占了上风。几百印第安人被杀害，几百名被俘获带回伊莎贝拉作奴隶。过后不久，又接到消息说大酋长卡奥纳博准备进攻圣托马斯堡，海洋统帅——副王决定派遣奥赫达带领士兵前去征剿。奥赫达带上16名骑兵，250名弓弩手，110名长铳手和20名军官出发了。哥伦布给他的指令是：活捉卡奥纳博。卡奥纳博深居内陆山地，拥有一支英勇善战的队伍。奥赫达挑选了一些骑兵，通过将近200英里的大森林，突然出现在卡奥纳博所在的村镇里，谎称是哥伦布派来的友好使节，邀请酋长到伊莎贝拉城堡去。卡奥纳博信以为真。便同奥赫达一道向伊莎贝拉进发。
卡奥纳博是带着大批卫队行进的。奥赫达施展了阴谋诡计。在途中，他取出一副特制的锃光闪亮的手铐脚镣向卡奥纳博炫耀，谎称这个东西是西班牙国王在节日骑马带在身上的装饰品，今天当做礼品赠送给他。如果他下河洗个澡，就可以给他戴上，就能像西班牙国王那样威严堂皇。卡奥纳博信以为真，一一照办，于是这副钢铁刑具就锁住了他的手脚。阴谋诡计一旦得逞，西班牙殖民者马上凶相毕露，把卡奥纳博捆在马上，把他只身绑架到伊莎贝拉。
几个礼拜以后，卡奥纳波的妹夫，一位住在岛的西南部的酋长贝西奇奥带队前来复仇被奥赫达打败。从此以后，印第安人被彻底地压服了。到1496年，西班牙人在那里可以为所欲为，高枕无忧了。
这只是哥伦布想要实现的第一个目标。他下令在岛内各地修筑城堡，并在那里驻扎武装部队，加强戒备。
哥伦布表面上执行伊莎贝拉的指示，善待印第安人。但实际上手段非常残忍。一些印第安人被割掉了耳朵和鼻子，许多印第安俘虏被砍了头。这是基督徒在新世界执行死刑判决的开始。
1495年，哥伦布为了尽可能多地搜括黄金，命令印第安人凡年龄在14岁以上的男人，每人每三个月就得缴纳能装满一个鹰脚铃那么多的金砂，作为贡品，否则就要缴纳用25磅棉花纺织成的布匹。酋长则每两个月就缴纳一葫芦的金砂，价值150马拉维迪。凡交不足数的，就要判处死刑。当时印第安人主要是从河床泥里去淘洗金砂的，在盛产金砂的河床，每人每年也只能淘到四个鹰脚铃的分量。哥伦布规定的贡金配额是无论如何也无法交足的，以致大批印第安人劳累致死。
有的人奋起反抗被杀害；有的逃进山区或饿死或病死；有的逃入森林被西班人放出搜寻的恶犬被咬死，完全陷入了奴隶的悲惨境地。
5. 争权夺利
在此期间，有关哥伦布在伊斯帕尼奥拉管理不善的信息不断地传到国王和王后那里。他们决定派遣自己的御厨、专事糖果糕点制作的胡安·德·阿瓜多去查明原因。此人曾在第二次西航时随船来过，因而对当地的情况有所了解。阿瓜多怀揣着1495年4月9日国王和王后颁发给他的一纸命令，委他以重任：代表国王和王后说话。阿瓜多同时还带来了一些事先写好的委托状。国王和王后的命令还要求驻扎在“印度”群岛的骑士们、绅士们和其他人员服从和信任阿瓜多。
1495年10月，一支4条船的船队到达伊莎贝拉，阿瓜多就在其中一条船上。当时哥伦布正在岛屿内地，接到巴托罗缪·哥伦布的通知后立即赶回伊莎贝拉城。
阿瓜多对哥伦布抱着敌对的态度，他和哥伦布之间开始了一场权力之争。阿瓜多逐步搜集了殖民地对副王不满的材料。哥伦布看到国王的糖果点心师——一个宫廷的仆从——竟然和他平起平坐，有时还以国王的名义批评和威胁自己时，感到极大的痛苦和耻辱。他认为，自己在印度群岛的权威受到了极大的损害。在此期间，一场飓风袭击了伊斯帕尼奥拉岛，伊莎贝拉港受到严重破坏。阿瓜多带来的四条船全部被毁。但哥伦布与他的矛盾和冲突却与日俱增。
此时，哥伦布想到必须返回西班牙，但无船可用，只能自己建造船只。在造船期间，为了削弱阿瓜多的势力，他任命大弟弟巴托罗缪任总督兼总司令，任命小弟弟迭哥做巴托罗缪的助手。他任命了自己的亲信随从弗朗西斯科·罗尔丹任市长，负责掌管伊莎贝拉城和全岛的司法权。罗尔丹后来羽翼丰满给哥伦布兄弟制造了很大的麻烦。这种任人唯亲的做法也成了别人、尤其是上层人物攻击他的口实。
国王下令，要哥伦布将病人和穷困者带回，还有些人的家属向皇家枢密院告了状，这些人也得到保证返回。共计二百二十余人。
1496年3月10日礼拜天，哥伦布乘“尼尼亚”号，阿瓜多乘新造的“印度”号离开伊莎贝拉港。
航行初期，逆风迫使他们在瓜德罗普岛停留，上岸补充淡水和食品，遭到岛上的加里布人的抵抗，双方均有伤亡。以后经过3个月的困苦航程，6月11日终于在加的斯港靠岸。哥伦布带来的30个印第安人只有少数幸存。死去的人中就有被俘虏的酋长卡奥纳波。
6. 再次赢得信任
哥伦布率领着两只船，经过52天的海上漂泊，1496年6月11日返回加的斯港。当他踏上陆地时，感到心力交瘁，明显地衰老了。年纪不过45岁，但头发和胡须都已雪白了。王室此时正在西班牙北边的某个地方，他等待着召见。
稍事休息之后，他动身前往塞维利亚。这一次，在他的队伍中虽然也有鹦鹉和印第安人，也带着金子，但已没有第一次返国时的轰动效应。他本人也明显地衰老了。满头白发，一脸胡须，面庞消瘦，眼眶凹陷。这一次他没有穿做工考究、装饰华丽的丝绸礼服，而是一件圣方济各会修士习惯穿着的深褐色的粗布袍子。他住修道院设备简陋的房子，吃粗劣的食物。他的这身打扮和一副憔悴的面容似乎是为了赢得人们对他的同情。面对包括布伊尔神甫在内的先期返回卡斯蒂利亚人对他的种种控告，他必须向国王说个明白。唐·胡安·德·方塞卡告诉他，他送来当奴隶贩卖的500名印第安人大部分死去，引起了国王的极大不安和烦恼。
哥伦布再一次有了机会在国王和王后面前申辩。他明白：与自己的批评者、诋毁者论战的时候到了。经过充分的准备，他胸有成竹的发言收到了一定的效果。他历数自己的困难：治理殖民地的时间太短，生活条件的艰苦，印第安人的反叛。后来，他向国王们献上了大小不等的金粒和一根特大的金项链。
国王和王后听着哥伦布的申述，被他的激情善辩和卓越口才所折服。哥伦布在这次申辩中，不再吹嘘他想象中的西潘古了。相反，他建议国王们拿出钱财建设现已被卡斯蒂利亚征服的新的土地。这一点投合了国王们的心意，对于他们来说，“印度”群岛事业中的最大收获是王室得到了新的领土，这是比金子更为宝贵的东西。但这个收获似乎来得太突然，西班牙国王们对它没有足够的思想准备。他们刚刚把西班牙境内的各个王国从以前的封建割据的混乱状态下解脱出来，还没来得及组织起一个强有力的统一的国家，一个新的帝国一夜之间又摆到了他们面前。如今，国王们对哥伦布的性格有了更多的了解，他与平松、方塞卡、布伊尔和阿瓜多等人关系恶化乃至破裂，反映了他的性格缺陷：专横霸道、急躁、傲慢与严酷。很明显，治理“印度”群岛的任务是哥伦布所不能胜任的。他所推行的种种政策，无论是针对西班牙殖民者，或是针对印第安人的，最后都以失败而告终。
第一次来到伊斯帕尼奥拉时，他想通过采取友善措施，让西班牙殖民者与印第安人和平共处，结果纳维达德被毁，留守人员被杀。后来使用武力征服土著人，也不见效。强迫他们劳动遭到抵制，强行向他们征税也没有多大收益，最后还是只有采取武力讨伐的手段逼迫土著人充当奴隶。由于印第安人拒绝劳动，而且从事农耕也非这个游猎民族之所长，那就只有把西班牙人弄来种地，哥伦布向国王们要500名雇佣人员，国王们只给了他330人。其中包括：侍从、海员、见习水手、各类官员、士兵、淘金工人、农民和园艺工人。王室还规定了这些人的薪水和膳食费用标准。这330人中有30名妇女，她们没有薪水，但每日可得膳食费12马拉维迪。王室规定，已经在伊斯帕尼奥拉的人员，继续领取自己的薪水。农民将得到种子和耕畜——母牛和母马。王室批准使用岛上的金子铸造货币。印第安人要向副王纳税，对那些不纳税的印第安人要实行惩罚①”。
① 《哥伦布评传》，第406页。
除此而外，哥伦布在个人权利方面还得到了国王们的种种优惠。1497年4月23日，国王们签署了一系列重要决定：“第一，禁止进入印度群岛黄金国的西班牙货主抬高供应给杰出发现者的商品价格；第二，授予海洋统帅招募他已提出的330人；第三，如果海洋统帅认为需要，这个数字可增加到500；第四，命令‘印度群岛财政部’司库，付给海洋统帅或他的代理人答应给予奖赏的那些人的奖金；第五，运往印度群岛和从那里运回的所有商品，在第一次成交时不付进出口税和任何其他税。”①
① 《哥伦布评传》，第406页。
“也是在4月23日这一天，国王们……明确批给他圣菲协议所规定的利益和特权；也是在这一天，他得到圣旨，授权他立下一份长子继承书；5月6日、4月23日授予他的税收豁免权又扩大到所有商品和税收项目；5月9日，国王们又指示‘高级会计’们，满足海洋统帅已付给或预付给印度群岛人员的工资总数。②”30日，皇家枢密院同意在印度群岛收支账目的管理中有他海洋统帅一名代表。
② 《哥伦布评传》，第408～412页
围绕如何解释圣菲协议中有关印度群岛收益权的问题，哥伦布与王室开展了长时间的激烈争论。国王们最后作了让步：除了第一次远航他花出去的钱外，哥伦布不再负担任何开支和本钱（他应该负担八分之一）；这就是说，直到此时为止的一切旅费和行政开支，他分文不付。
1498年2月18日和19日，唐娜·伊萨贝拉尔批准哥伦布的两个儿子作为王室的伴童，每人津贴9700马拉维迪。……就这样，海洋统帅使他两个儿子在宫廷里有了保障；甚至在王子唐·胡安死后，他的这两个伴童仍保留着。”
6月22日，皇家的三道新的命令表明，哥伦布心中最秘密的思想也取得了最后胜利：他获准将普通刑事犯移往伊斯帕尼奥拉岛；在伊斯帕尼奥拉期间，刑期加倍计算，10年既抵无期徒刑。此外，犯人如愿意在伊斯帕尼奥拉落户，将免于服刑……这一天，还授权副王给自愿居住在伊斯帕尼奥拉满4年以上的人分配土地。
哥伦布战胜了他的所有批评者和对手。国王们采纳了他的计划，批给了他的特权并答应给他新的好处。
哥伦布很得意于自己获得的胜利，于是开始准备他的第三次航行。
国王们命令付给海洋统帅600万马拉维迪作为远征费用。
